Synopsis
Setelah menghilangkan stasiun relay pertama Requiem, Malaikat Agung dan Abadi bergegas ke bulan untuk bergabung dalam serangan di pangkalan Daedalus, hanya untuk menemukan jalan mereka dihalangi oleh benteng bergerak Mesias. Kira memberitahu Athrun dan Malaikat Agung untuk melanjutkan dan menghancurkan meriam Requiem, sementara dia dan Yang Abadi tetap tinggal untuk menghadapi Mesias. Malaikat Agung berlomba menuju markas Daedalus, dengan Minerva dan Destiny Gundam milik Shinn sedang mengejar, dan Athrun terpaksa melawan Shinn dan Lunamaria untuk melindungi Malaikat Agung. Sementara itu, Yang Abadi memimpin serangan terhadap Mesias, dan Legenda Gundam milik Rey ikut bertarung untuk menantang Strike Freedom milik Kira. Saat pertempuran kacau terjadi di permukaan bulan, nasib akhir umat manusia berada dalam bahaya. Dua tahun setelah perang antara Earth Alliance dan ZAFT, konflik kedua negara kembali memanas. Shin Asuka, mata karakter utama baru penuh dengan kesedihan karena keluarganya terbunuh di Orb selama perang. Sementara itu, Athrun bingung antara melindungi Cagalli di Orb atau melakukan sesuatu untuk perang. Dengan Mobile Suit baru yang dikembangkan oleh ZAFT dan penculikan tiga Ponsel baru oleh tiga Pilot Aliansi Bumi, cerita baru dimulai.